【原创】很久没有来了,说说我最近做的这个 Project, 更新 1.4 桌面版本

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    coolwulf
    去年的时候,我一个在芝加哥比我小几级的南京大学校友去世了。乳腺癌,发现得晚了,才34岁,留下了一个4岁的孩子。非常可惜。想想能不能做点什么事情可以帮助大众来提高乳腺癌的早期检测成功率。因为如果在 stage 1 发现乳腺癌的话,5年存活率是99%。

    想想能否写一个完全免费的网站和 ios app 来让用户可以迅速得到 X-ray Mammogram 的诊断结果。至少可以是 2nd Opinion. 因为用户做完 Mammography 之后有时候需要等好几天才能有 Radiologist 来读片子。而且现在 Radiologist 有20% 的概率会漏掉早期的肿瘤。我决定用 Deep Learning (深度学习) 来做这件事情。

    对于一个足够好的 Deep Learning Model, 一是要有足够多的数据 (即使是做 Transfer Learning 的情况下), 二是要有足够强大的计算力。为了做成这件事情,我在本地搭建了一个 50 个 Nvidia Geforce GTX 1080 Ti 的 GPU cluster, 这是搭成之后的硬件:






    有了硬件之后就是设计 Model 和收集数据。我从北美和欧洲的几个研究组获取了 Annotated Breast Mammo 的数据。这些 Annotation 大多都是根据北美 ABR certified 的 Radiologist 做出的。也就是如果这个 Model 能够训练好,就可以达到 ABR Certified Radiologist 的 Reading 的平均水平或者更好。

    最终的结果我在欧洲的 InBreast 数据上做了测试,达到了 90% 的准确度 (AUC).

    我觉得这个 Model 已经可以给大众实用了,在这里公开出来:

    http://neuralrad.com

    你可以直接上传 .jpg 形式的 Mammo 图片,这个 AI 会给出判断结果. 这是 Screenshot:



    这个网站是完全免费使用的。我现在还在继续更新和改进 Model, 也在联系国内的几家医院来合作来获取更多的数据来 Training.


    University of Kentucky Hospital 和国内的一家合作公司已经在测试了这个模型

    乳腺癌检查去年有个全世界竞赛,他们先用这个竞赛获得第二名程序测试了 MIAS 数据,漏了10个 case, 然后他们用我的网站测试了一下,只漏了一个

    这个第二名程序发表了一篇自然杂志的论文:

    https://www.nature.com/articles/s41598-018-22437-z


    这两天,我也公布了完全免费的桌面版本,支持读取和浏览 dicom 文件,并自动转换 Normalize for AI analysis. 在 InBreast 的 Dicom 数据上 AUC (准确率)大概 93%。桌面版本截图:


    下载地址就在网页主页上。

    【07/17 更新 桌面版本1.4】
    + 修复标注的一个bug
    + 标注保存文件annotation.txt 保存在图像当前目录下

    [06/21/2018 更新]
    更新 NeuralRad Mammo 桌面客户端 1.3 版本,针对 FujiFilm 等平板厂商的 dicom 图像提供选择不使用 Normalization, 下载地址:http://neuralrad.com:5000/static/NeuralRad_Mammo_Installer.exe

    [06/11/2018 更新]
    NeuralRad Mammo AI 桌面版本更新到了 1.2, 修复 dicom/jpg 文件路径有中文或者空格导致无法返回正确结果的问题。依然从主页http://neuralrad.com免费下载
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    mac_10.8
    牛逼了
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    hipadzyk
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    wshyiyi

    ~小尾巴
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    ABTQA
    回复1#coolwulf
    牛 iOS fly ~
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    coolwulf
    University of Kentucky Hospital 和国内的一家合作公司已经在测试了这个模型

    乳腺癌检查去年有个全世界竞赛,他们先用这个竞赛获得第二名程序测试了 MIAS 数据,漏了10个 case, 然后他们用我的网站测试了一下,只漏了一个

    这个第二名程序发表了一篇自然杂志的论坛:

    https://www.nature.com/articles/s41598-018-22437-z
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    xinzhu0372

    为您点赞
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    yoyoma10
    牛逼!严重支持 iOS fly ~
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    fataleye
    牛!造福大众
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    ProteinPig
    造福人类的功德事业
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    mailwmj
    nb.... iOS fly ~
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    coolwulf
    这两天,我也公布了完全免费的桌面版本,支持读取和浏览 dicom 文件,并自动转换 Normalize for AI analysis. 在 InBreast 的 Dicom 数据上 AUC (准确率)大概 93%, 下载地址:

    http://neuralrad.com

    截图:

  • h
    heizhugan
    这个好牛,关键是还免费。。。
  • b
    bfwinxp
    强烈支持 发自小霸王学习机
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    qwwe44
    牛逼大了 造福人类 iOS fly ~
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    gj91
    佩服佩服…神一样的选手…
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    jwj
    回复1#coolwulf
    厉害了 本人也是医生 不会编程是我最大的痛
  • p
    pinklysd
    佩服!大爱无疆
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    coolwulf
    这里上传两张测试图片给大家,如果大家想测试这个网站或者桌面版本的可以使用这两张图片:


  • 微笑的刺猬
    厉害:+1: iOS fly ~
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    dongdong5915
    赞👍,真心牛逼
  • k
    kingsmart
    严重点赞👍👍👍 IOS fly~
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    netzerg
    牛!
    作为乳腺科医生,我想说的是:大陆人群乳腺X线与欧美人群有差异,诊断率相对较低,需要结合超声诊断,所以能否在这个AI上加入超声的诊断呢?

    不过话说回来,国内做X线应该不需要等几天才能出报告。
  • 4
    4in5
    mark高人HiPDA·NG
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    heavenbow
    牛人。。
  • j
    jckimi
    这个太nb了 Kimi
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    nkbirdie
    牛,支持楼主!
  • h
    hongtao008
    堡主厉害.
  • t
    theallz
    牛!佩服!
  • 大马
    厉害,时代之光!
  • 真治
    大神啊!!!
  • l
    lp452
    厉害 佩服啊
  • a
    aedieno
    堡主牛 iOS fly ~
  • e
    everchens
    科技改变生活
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    cacarot
    牛🐂X
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    pepsin
    牛逼啊 iOS fly ~
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    ech@os
    给您点赞!
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    cybervsq
    感觉整个论坛最牛就是你了,老u,穷叔都比不上
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    blue889
    这才是真正的技术大牛!
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    FQX
    放射性诊断应该是机器学习在医学最早最成功的应用了。
    好奇楼主的训练集有多少个样本,为什么选择买硬件而不是租云服务来进行训练。 iOS fly ~
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    qiuike
    楼主,你的工作会非常有意义。

    当然,经济上也会非常有价值。
  • 1
    155101707
    北美一霸
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    y
    大神厉害!小尾巴~
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    VooDoo_11
    膜拜大神 iOS fly ~
  • 西
    西西弗的神话
    厉害!小尾巴~
  • q
    qiuike
    回复25#netzerg


    我觉得完全是可能的,但是需要大量的超声波检测的数据来训练AI的神经网络。
  • p
    poet_lee
    牛~佩服!
  • 蓝色潜水艇
    楼主牛逼,造福大众 iOS fly ~