【移動速度の高速化 （I・II・III・IV）】
パーティの移動速度を通常の2倍の速度に変更できます。IIとIIIではさらにスピードを上げた４倍速も選択できます。
【難易度イージープレイ （I・II・III・IV）】
ゲームバランスを、NORMAL・EASY・VERY EASYの3種類から変更できます。難易度により、敵とのエンカウント率と戦闘で得られる経験値・メセタ（お金）の量が変化します。
【ひらがなメッセージ化（Iのみ）】
オールカタカナだったメッセージをひらがな交じりのメッセージに変更します。（メッセージはセガサターン版『ファンタシースターコレクション』と同様の仕様となります）
【戦闘アニメーションの高速化（IIのみ）】
ボタンを押している間、戦闘アニメーションを高速化します。
【ウインドウ開閉の高速化（IIのみ）】
ウインドウの開閉が高速化されます。
【セーブポイントの増加（IIIのみ）】
オリジナル版では２箇所しか無かったセーブポイントを４つに増加しました。（この機能のみ必須仕様となり、本ソフトでは必ずセーブポイント数は４つとなります）
【中断機能（テキストアドベンチャーのみ）】
ゲームのプレイ状態をそのままセーブし、次回プレイしたときは最後にセーブしたところから始まります。なお８人のシナリオはすべて１つのデータでセーブされますので、８人並行プレイも可能です。
【セーブダイアログ変更（I・II・III・IV）】
ゲーム内のセーブ時に、記録ミスが無いよう毎回メモリーカードへアクセスするか、アクセスのわずらわしさを避け任意のタイミングでメモリーカードへセーブするかを変更できます。
![]()
![]()
![]()
![]()