EMP这货的实用性局限很大，它主要是通过大规模的电磁脉冲（时间最长持续约1秒）来破坏以晶体管为基础的各种电子设备，但是问题在于：它主要是通过伽玛脉冲来进行攻击，这种攻击是大范围、无定向、低精度的，由于这类武器需要核能来产生和扩大电磁脉冲，因此各国将它定位为战略武器而不是战术武器，从而大大限制了它的适用范围（由于它的地位与战略/战术核武器相等，因此很难在局部性战争中使用），而从另一个角度来讲，由于军用电子设备大多经过电磁屏蔽、石墨加固等防护措施，能够相对有效地防范EMP（至少很难造成永久性损坏），而用EMP攻击敌方的民用措施，则效果远不如直接用核武器攻击的效果好，但造成的政治后果同直接使用核武器是相同的。
另外EMP还有一个极大的局限性在于：它仅仅对人类社会发展中的某个阶段的电子设备起作用，微机电器件与纳米技术的最新进展，终究会使器件与传感器的尺寸远远小于电磁脉冲的波长。如果微小器件足够小，就能对EMP武器免疫，因为微波频率不能以足够的引起损坏的能量耦合给该器件。而过于古老的电子设备（如上个世纪6,70年代采用真空电子管制造的古董式电子设备）由于运行机制不同，EMP对其也无法起到破坏作用，目前2010年以后生产的大部分民用设备（包括微机CPU、手机集成芯片、嵌入式CPU等），其关键部件的尺寸都已接近甚至超过EMP攻击范围的极限，估计在不久的将来，EMP武器很有可能会退出历史舞台。
